Henrique,
Tem sim, você pode criar uma tarefa agendada ou um script com o comando abaixo:
"WBADMIN DELETE SYSTEMSTATEBACKUP -keepVersions:2 -quiet"
Onde o parametro "keepVersions" indica a quantidade de backups que você quer manter.
Abs
Ricardo F Firmino MCP/MCTS - Se a resposta lhe ajudou, marque como util.